“盐城工学院水生动物免疫与疾病研究所”成立于2019年，现有教师8名，其中教授2名，副教授3名，讲师3名，均具有博士学位；硕士生导师5名。研究所的宗旨是面向国家战略需求和国际水产科学前沿，围绕我国水生动物资源可持续利用的重大科技问题，对水产病害的病原生物学和流行病学开展系统的研究，建立早期预警和快速诊断技术；探索水产动物的免疫系统组成、免疫调控与适应机制、病害免疫防治原理，在水产动物免疫学、水产动物疾病防控等方面实现重大理论突破与技术创新，获得一批具有自主知识产权的先进性成果。

实验室的主要研究内容聚焦以下四个方向:

l 水生动物基础免疫学

l 水生动物病毒致病机理及防控技术

l 水生动物病原菌致病机理及防控技术

l 水产用抗生素替代品开发及调控机制研究