学院拥有2个硕士学位授权点（生物与医药、食品与营养）、1个省级重点建设学科（生物工程）、1个校级重点建设学科（水产学）。
学院拥有江苏省海洋滩涂生物化学与生物技术重点建设实验室、江苏实验教学示范中心（海洋生物工程实践教育中心）、江苏省沿海池塘养殖生态重点实验室、江苏省滩涂底栖生物学重点实验室、江苏省沿海池塘养殖鱼类饲料工程技术研究中心、盐城市沿海水产养殖公共技术服务中心等各类教学科研平台11个。
序号 | 平台名称 | 等级 |
1 | 江苏省海洋生物工程实践教育中心 | 省级 |
2 | 江苏省海洋滩涂生物化学与生物技术重点建设实验室 | 省级 |
3 | 江苏省滩涂底栖生物学重点实验室 | 省级 |
4 | 江苏省沿海池塘养殖生态重点实验室 | 省级 |
5 | 江苏省沿海池塘养殖鱼类饲料工程技术研究中心 | 省级、校企共建 |
6 | 盐城市水产养殖公共技术服务中心 | 市级、校企共建 |
7 | 盐城市滩涂养殖与饲料工程技术研究中心 | 市级、校企共建 |
8 | 盐城市海涂生物资源综合利用工程技术研究中心 | 市级、校企共建 |
9 | 盐城市特种水产饲料工程技术研究中心 | 市级、校企共建 |
10 | 盐城工学院沿海滩涂农业研究所 | 校级、校企共建 |
11 | 盐城工学院海洋生物产业研究院 | 校级、校企共建 |
